Создайте «Схему скидки» и «Автоматическую скидку». Создайте «Группу видов оплаты»: в карточке вида оплаты («Настройки» → «Дополнительные» → «Настройка видов оплат») на вкладке «Группы» (новую группу можно создать оттуда же, достаточно наименования).
В схеме скидки укажите «Наименование» и поставьте флаги «Активность» и «На чек».
В условиях укажите «Наименование», «Параметры скидки» и выберите «Группу видов оплаты». Скидка применяется при использовании вида оплаты из этой группы.